Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC182A6NF36 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms