Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTP11Q9Y3A2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms