Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAB39Q9Y376 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms