Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RABGEF1Q9UJ41 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RABGEF1Q9UJ41 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms