Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms