Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
HIGD1BQ9P298 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms