Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms