Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms