Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT57Q9NWB7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT57Q9NWB7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms