Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATG3Q9NT62 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms