Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASCL3Q9NQ33 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASCL3Q9NQ33 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms