Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms