Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRA1Q9HD15 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms