Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM38AQ9H6F2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM38AQ9H6F2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms