Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIPCQ9C0C6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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