Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms