Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB11FIP5Q9BXF6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms