Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB2BQ9BVA1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TUBB2BQ9BVA1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms