Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSF3RQ99062 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSF3RQ99062 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms