Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf72Q96LT7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms