Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHDQ96IW2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SHDQ96IW2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms