Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PGAM5Q96HS1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PGAM5Q96HS1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGAM5Q96HS1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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