Protein–RNA interactions for Protein: Q96CU9

FOXRED1, FAD-dependent oxidoreductase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXRED1Q96CU9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXRED1Q96CU9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXRED1Q96CU9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms