Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX13Q92968 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX13Q92968 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX13Q92968 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX13Q92968 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX13Q92968 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX13Q92968 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PEX13Q92968 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms