Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms