Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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CLIP4Q8N3C7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP4Q8N3C7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP4Q8N3C7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP4Q8N3C7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP4Q8N3C7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLIP4Q8N3C7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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CLIP4Q8N3C7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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CLIP4Q8N3C7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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CLIP4Q8N3C7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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CLIP4Q8N3C7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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CLIP4Q8N3C7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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CLIP4Q8N3C7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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CLIP4Q8N3C7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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CLIP4Q8N3C7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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CLIP4Q8N3C7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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CLIP4Q8N3C7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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CLIP4Q8N3C7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP4Q8N3C7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms