Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPAP2Q8IXW5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms