Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LMNTD2Q8IXW0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms