Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP31Q70CQ4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP31Q70CQ4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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