Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VSTM1Q6UX27 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms