Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HES3Q5TGS1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms