Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ESCO2Q56NI9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms