Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms