Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GREB1Q4ZG55 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
GREB1Q4ZG55 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GREB1Q4ZG55 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GREB1Q4ZG55 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GREB1Q4ZG55 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms