Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZBED5Q49AG3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZBED5Q49AG3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms