Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HFEQ30201 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HFEQ30201 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HFEQ30201 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HFEQ30201 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HFEQ30201 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HFEQ30201 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HFEQ30201 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HFEQ30201 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HFEQ30201 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HFEQ30201 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HFEQ30201 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HFEQ30201 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HFEQ30201 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HFEQ30201 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HFEQ30201 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HFEQ30201 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HFEQ30201 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HFEQ30201 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HFEQ30201 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HFEQ30201 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HFEQ30201 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HFEQ30201 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HFEQ30201 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HFEQ30201 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HFEQ30201 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HFEQ30201 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms