Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCK2Q16822 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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