Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECM1Q16610 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ECM1Q16610 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
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