Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGCAQ16586 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SGCAQ16586 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SGCAQ16586 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCAQ16586 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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