Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CARTPTQ16568 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CARTPTQ16568 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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