Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNAPC1Q16533 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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