Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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CRY1Q16526 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CRY1Q16526 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
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CRY1Q16526 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CRY1Q16526 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRY1Q16526 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRY1Q16526 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRY1Q16526 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRY1Q16526 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRY1Q16526 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRY1Q16526 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRY1Q16526 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRY1Q16526 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRY1Q16526 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRY1Q16526 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRY1Q16526 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRY1Q16526 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRY1Q16526 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRY1Q16526 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRY1Q16526 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRY1Q16526 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRY1Q16526 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRY1Q16526 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CRY1Q16526 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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