Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABRA6Q16445 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms