Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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ZFHX3Q15911 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
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ZFHX3Q15911 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ZFHX3Q15911 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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