Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CEBPEQ15744 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms