Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TNIP1Q15025 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TNIP1Q15025 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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