Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL19A1Q14993 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms