Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NFIXQ14938 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NFIXQ14938 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFIXQ14938 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NFIXQ14938 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NFIXQ14938 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NFIXQ14938 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NFIXQ14938 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NFIXQ14938 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NFIXQ14938 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NFIXQ14938 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NFIXQ14938 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFIXQ14938 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NFIXQ14938 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFIXQ14938 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFIXQ14938 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NFIXQ14938 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFIXQ14938 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NFIXQ14938 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFIXQ14938 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFIXQ14938 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFIXQ14938 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFIXQ14938 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFIXQ14938 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFIXQ14938 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFIXQ14938 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFIXQ14938 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NFIXQ14938 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFIXQ14938 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFIXQ14938 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFIXQ14938 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NFIXQ14938 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NFIXQ14938 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFIXQ14938 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFIXQ14938 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NFIXQ14938 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFIXQ14938 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NFIXQ14938 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NFIXQ14938 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NFIXQ14938 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFIXQ14938 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFIXQ14938 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NFIXQ14938 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFIXQ14938 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NFIXQ14938 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFIXQ14938 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFIXQ14938 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NFIXQ14938 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NFIXQ14938 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NFIXQ14938 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NFIXQ14938 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NFIXQ14938 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NFIXQ14938 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFIXQ14938 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFIXQ14938 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NFIXQ14938 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NFIXQ14938 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NFIXQ14938 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NFIXQ14938 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NFIXQ14938 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIXQ14938 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NFIXQ14938 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFIXQ14938 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIXQ14938 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIXQ14938 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIXQ14938 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIXQ14938 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIXQ14938 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFIXQ14938 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFIXQ14938 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIXQ14938 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NFIXQ14938 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFIXQ14938 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NFIXQ14938 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIXQ14938 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NFIXQ14938 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NFIXQ14938 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NFIXQ14938 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFIXQ14938 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIXQ14938 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NFIXQ14938 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NFIXQ14938 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIXQ14938 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIXQ14938 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NFIXQ14938 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFIXQ14938 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFIXQ14938 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFIXQ14938 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NFIXQ14938 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFIXQ14938 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NFIXQ14938 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NFIXQ14938 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFIXQ14938 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFIXQ14938 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFIXQ14938 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NFIXQ14938 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NFIXQ14938 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NFIXQ14938 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NFIXQ14938 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NFIXQ14938 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
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