Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDCD11Q14690 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms