Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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FAM53BQ14153 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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FAM53BQ14153 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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FAM53BQ14153 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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FAM53BQ14153 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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FAM53BQ14153 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM53BQ14153 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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